Фармацевтика Аналитика Акта

Абстрактный

Колебательные исследования и расчеты DFT цитозина, тиоцитозина и их катионов и анионов

Ядав РА, Рашми Сингх и Маюри Шривастава

Расчеты DFT были выполнены для вычисления оптимизированных молекулярных геометрий, зарядов APT и основных колебательных частот вместе с их соответствующими ИК-интенсивностями, рамановскими активностями и коэффициентами деполяризации рамановских полос для нейтральных молекул Cyt и TCyt и их катионов и анионов с использованием метода DFT/B3LYP с базисным набором 6-311++G** с использованием программного обеспечения Gaussian-03. TCyt, Cyt+ и TCyt+ показывают плоские структуры и принадлежат к точечной группе симметрии Cs, в то время как Cyt, Cyt- и TCyt- обладают неплоскими структурами с точечной группой симметрии C1. Конформационный анализ был проведен для получения наиболее стабильных конфигураций этих молекул. Нормальные моды колебаний для всех видов были назначены на основе PED, полученных из нормального координатного анализа с использованием программного обеспечения GAR2PED. Информация о размере, форме, распределении плотности заряда и месте химической реактивности молекулы была получена путем сопоставления изоповерхности электронной плотности с поверхностями молекулярного электростатического потенциала (МЭП). Энергетический зазор от HOMO до LUMO цитохрома составляет 5,2963 эВ, а у TCyt — 5,0062 эВ.