Журнал судебной биомеханики

Абстрактный

Отслеживание браконьерства на тигра: необходимость гармонизированных данных ДНК по многим локусам в странах ареала тигра - SP Goyal - Институт дикой природы Индии, Индия

С. П. Гоял, С. К. Сингх, С. Мишра и Имран Хан

Целью сохранения тигров является поддержание достаточно большой популяции каждого подвида в его естественной среде обитания, что обеспечивает высокую вероятность долгосрочного выживания. Браконьерство для незаконной торговли является серьезной угрозой по всему ареалу. Успех в сохранении тигров заключается в сокращении глобальной торговли частями и продуктами тигров. Разработка генетических инструментов позволила отслеживать браконьерство исчезающих видов до их исходной популяции, однако данные, доступные на данный момент из разных заповедников тигров, не позволяют достичь этих целей. Проект направлен на создание профиля данных генотипирования популяции тигров в Индии и использование для отслеживания случаев браконьерства до ее географического происхождения. Мы изучили генетическую структуру тигров на основе митохондриальной и ядерной ДНК, используя образцы помета, собранные в заповедниках тигров, и образцы тканей. Данные митохондриальной ДНК указывают на уникальный гаплотип в гене цитохрома b, который использовался для дифференциации популяции от северной (заповедники тигров Раджаджи и Пакке) до остальных популяций тигров. Основной проблемой при разработке профиля генотипирования из ядерной ДНК является выявление подходящих микросателлитных локусов, которые подходят для образцов фекалий плохого и хорошего качества, поэтому мы провели скрининг 60 локусов. Из них 26 локусов находились в диапазоне от умеренного до хорошего для использования их в таких образцах, которые были <200 п.н. Мы изучили генетическую структуру образцов, собранных из популяции тигров Rajaji-Corbett (RC), Ranthambhore Tiger Reserve (RTR), Buxa Tiger Reserve (BTR), Central India (CI) и zoo (Z). Средняя наблюдаемая гетерозиготность варьировалась от 0,28 до 0,69 и была в порядке CI>RC>BTR>Z>RTR. Наблюдаемый средний эффективный аллель на локус варьировался от 1,53 до 3,76 с самым высоким значением в популяции RC. Значения Fst для структурирования популяции указывают на дифференциацию популяции от умеренной до высокой среди исследованных популяций, а наблюдаемые значения (Fst>0,033) подходят для байесовского распределения популяции. Генетическая изменчивость в популяции составила около 82%, тогда как среди популяции она составила 18%. Мы обсуждаем распределение популяции на основе байесовского подхода для отслеживания браконьерства тигра. Мы обсуждаем локусы, которые легко назвать, и предлагаем использовать общие продукты ПЦР для калибровки и гармонизации данных, полученных на разных машинах в странах ареала.