Журнал биомолекулярных исследований и терапии

Абстрактный

Прогнозирование трехмерной структуры каталитического домена человеческого LMTK3 в конформации DYG-in

Лубна Аллам, Виаме Лахлили, Зинеб Тархда, Джихане Акачар, Фатима Грифи, Хамид Эль-Амри и Азеддин Ибрагими

Лемурская тирозинкиназа 3 (LMTK3) играет ключевую роль в регуляции активности α-эстрогенового рецептора (ERα). Она была определена как важный фактор, участвующий в процессе эндокринной резистентности у пациентов с раком молочной железы, ускоряющий дисперсию и инвазию опухолевых клеток, которые являются первыми шагами метастатического процесса. При отсутствии кристаллизованной структуры LMTK3 и для изучения ее ингибирования мы сгенерировали ее трехмерную структуру. Мы сконструировали киназу LMTK3 в ее активном состоянии (DYG-in), используя подход моделирования гомологии. Оценка сгенерированной модели несколькими инструментами показала надежность предсказанной трехмерной структуры, а хорошее качество модели стереохимических характеристик было подтверждено инструментом PROCHECK. В заключение следует отметить, что подход стыковки, используемый для изучения взаимодействия LMTK3-АТФ, позволяет нам определять ключевые остатки сайта связывания АТФ, которые могут быть полезны при разработке потенциальных конкурентных ингибиторов АТФ человеческого LMTK3.