Журнал биомолекулярных исследований и терапии

Абстрактный

Ширина протеома плазмы человека по сравнению с линией раковых клеток и бактерий

Андрей Лисица, Екатерина Поверенная, Елена Пономаренко и Александр Арчаков

Полное секвенирование генома выявило количество генов, кодирующих белки, в данном организме, что можно считать первым приближением молекулярной сложности. Из-за посттранскрипционных и посттрансляционных модификаций, таких как сплайсинг РНК, полиморфизмы, ковалентные модификации и деградация, общее количество различных видов белков (протеом) может быть намного больше, чем количество генов, кодирующих белки. Двумерный гель-электрофорез можно использовать для оценки ширины человеческого протеома. Количество пятен, полученных с различными красителями (красителями) при различных условиях загрузки белка, может дать приблизительное представление о количестве различных белков в образце. Данные по плазме и клеточным линиям человека, а также по бактериальным клеткам были исследованы для определения зависимости количества пятен от чувствительности красителя. Предполагая, что каждое пятно представляет собой отдельный вид белка, зависимость пятна от чувствительности была применена в качестве оценки ширины протеома. Теоретически в 1 л плазмы крови содержится 1,75 млн протеоформ, то есть 18 тыс. видов на отдельную клетку HepG2 и 6700 видов на бактерию.