Журнал фармакогеномики и фармакопротеомики

Абстрактный

Распространенность редких вариантов, потенциально важных для ответа на лекарства, используемые для лечения сердечно-сосудистых заболеваний, среди населения Литвы

Пранцулис А, Ранелис Т, Амброзайтита— Л, УктверитА— И, ДоммаркенА— И, БурокенА— Н, Куа инскиенА— З.А. и Куа инскас В.

Сердечно-сосудистые заболевания (ССЗ) являются одной из основных причин смерти среди европейцев и во всем мире. Основные факторы, которые считаются релевантными для эффективности или побочных реакций на лекарства (ПРЛ), вызванных препаратами, используемыми для лечения ССЗ, были выявлены с помощью исследований GWAS, в основном с использованием массивов генотипирования общих вариантов низкой плотности. В этом исследовании было проведено секвенирование всего экзома (WES) для выявления геномных вариантов, релевантных для лечения ССЗ. Исследуемая группа включала 98 (49 мужчин и 49 женщин) здоровых неродственных лиц из литовской популяции, сообщивших о себе, по крайней мере, с тремя поколениями литовской этнической принадлежности и проживающих в одном этнолингвистическом регионе. После проведения WES генетические локусы 55 генов, которые были сообщены как релевантные для эффективности или побочных реакций на лекарства, вызванных препаратами, используемыми для лечения ССЗ, были проанализированы с помощью программного обеспечения LifeScopeTM и ANNOVAR. Анализ небольших инделей в выбранных регионах выявил 13 экзонных инделей со сдвигом рамки считывания и один вариант интронного сайта сплайсинга, которые могут влиять на эффективность или вызывать нежелательные реакции у пациентов, лечившихся от сердечно-сосудистых заболеваний. Более 400 потенциально значимых SNV с различной частотой были обнаружены в генах, которые, как сообщается, важны для лечения сердечно-сосудистых заболеваний. Анализ силы доказательств выявил 14 SNV, которые, скорее всего, будут важны для лечения сердечно-сосудистых заболеваний. Распределение частот нескольких вариантных аллелей, которые, как было показано, очень важны для лечения сердечно-сосудистых заболеваний в генах CYP2D6 (rs16947) и ADRB1 (rs1801253), а также нескольких вариантов в генах CYP2C9 и NAT2, как было установлено, значительно (p < 0,05) отличается от других популяций европеоидной расы, что свидетельствует о потенциальной пользе фармакогеномного тестирования перед лечением в литовской популяции. Исследование проводилось в рамках проекта LITGEN. Проект LITGEN (VP1-3.1-ŠMM-07-K-01-013) финансировался Европейским социальным фондом в рамках Глобального гранта.