Кэтрин Р. Стейн, Беннет Дж. Джардина, Хуэй-Лин Чан *
Секреция белка является фундаментальным процессом во всех живых клетках. Белки, содержащие сигнал ER, секретируются классическим путем, тогда как белки без последовательности ER секретируются неклассическим путем. Последние данные свидетельствуют о том, что большое количество белков без сигнала, включая метаболические ферменты, транскрипционные факторы, факторы трансляции, белки теплового шока и антиоксидантные белки, секретируются различными клетками, которые варьируются от бактерий до человека. Кроме того, секреция глюконеогенных ферментов наблюдалась у бактерий, грибов, паразитов и клеток млекопитающих. Глюконеогенные ферменты секретируются в периплазму, когда Saccharomyces cerevisiae выращиваются в условиях низкого содержания глюкозы. Распределение глюконеогенных ферментов в периплазме/внеклеточной фракции Saccharomyces cerevisiae наблюдалось с помощью иммуно-ТЭМ, подтверждено протоколом экстракции и идентифицировано в масштабном протеомном исследовании. Ожидается, что существуют и другие белки, у которых отсутствует сигнальная последовательность ER и которые используют неклассический путь для секреции. Действительно, с помощью протеомики было идентифицировано 92 белка, которые присутствовали во внеклеточной фракции, и более 95% белков не имеют последовательности ER. Таким образом, неклассический путь является основным путем секреции белков в Saccharomyces cerevisiae. В этой обзорной статье основное внимание уделяется использованию нескольких методов, включая иммуно-ТЭМ, протокол экстракции и протеомику, для идентификации белков, которые присутствуют во внеклеточной фракции в Saccharomyces cerevisiae, и сравнению набора данных, полученных в дрожжах, с другими секретомными исследованиями, проведенными на ряде организмов от бактерий до человеческих клеток. К распространенным белкам относятся метаболические ферменты, белки теплового шока, антиоксидантные белки и факторы трансляции. Поэтому секреция этих белков широко наблюдается у разных видов.