Журнал инфекционных заболеваний и диагностики

Абстрактный

Влияние циклов замораживания-оттаивания на целостность культуральных жидкостей вируса SARS-CoV-2 и образцов клинических остатков при тестировании антигенов или нуклеиновых кислот

Хаджира Нур Хусейн, Хали Уикс, Дерек Чжоу, Дивья Джозеф, Брук Лам, Хайдонг Сюй, Чуши Чжан, Кецин Грегг, Вэньли Чжоу*

Сохранение при сверхнизких температурах стало золотым стандартом для долгосрочного хранения многих типов клинических образцов, включая вирус SARS-CoV-2. Замороженные образцы можно легко транспортировать и тестировать позже. Кроме того, деидентифицированные замороженные остатки образцов являются ресурсами для многих доклинических или клинических исследований. Поэтому крайне важно понять, могут ли циклы замораживания-оттаивания (FTC) отрицательно влиять на эффективность теста SARS-CoV-2 при тестировании замороженных образцов. Некоторые ранние исследования предполагают, что FTC повышают порог цикла (Ct) обратной транскрипции ПЦР в реальном времени (RT-PCR или RT-qPCR), что указывает на потенциальную деградацию нуклеиновой кислоты SARS-CoV-2 после FTC, в то время как другие не сообщали о каких-либо существенных изменениях в нуклеиновых кислотах SARS-CoV-2 после FTC. Более того, влияние FTC на эффективность теста на антиген SARS-CoV-2 почти не сообщается.

В этом исследовании мы провели парные тесты на нуклеиновые кислоты и быстрые антигены на одних и тех же образцах, чтобы исследовать и напрямую сравнить, как FTC влияют на производительность двух типов тестов. Были изучены как инактивированные образцы вирусной культуральной жидкости, так и образцы клинических остатков. Наши результаты показали, что FTC оказали минимальное отрицательное влияние на производительность быстрого теста на антиген SARS-CoV-2, и результаты теста оставались в значительной степени неизменными на протяжении FTC, тогда как значения Ct ОТ-ПЦР увеличивались с увеличением количества FTC. Кроме того, наши данные также продемонстрировали, что SARS-CoV-2 лучше сохраняется в вирусной транспортной среде (VTM), чем в фосфатно-солевом буфере (PBS) во время FTC в отношении тестирования нуклеиновых кислот.