Журнал передовой химической инженерии

Абстрактный

Влияние условий кристаллизации белковых конструкций и пространственных групп на разработку лекарственных препаратов на основе структуры

Орли Дым

Трехмерная структура апо-белков и белков с ингибиторами обеспечивает основу для структурно-ориентированных исследований дизайна лекарств, а также используется в процедурах стыковки для поиска более эффективных лекарств. Будут представлены конкретные примеры дизайна лекарств ацетилхолинэстеразы (AChE) и фосфотриэстеразы (PTE) с использованием рентгеновской кристаллографии. Сравнительный анализ между подходом к компьютерному стыковочному дизайну лекарств и кристаллическими структурами AChE показал, что положение лигандов в ущелье активного центра фермента зависит от условий кристаллизации. Спектроскопические данные и результаты термической стабильности подтвердили такую ​​разницу в расположении лигандов. Эти результаты имеют значение для структурно-ориентированного дизайна лекарств с использованием процедур стыковки. Мы также проанализировали девятнадцать кристаллических структур апо и нескольких аналогов фосфоната (OP), связанных с несколькими высокоразвитыми вариантами PTE. Помимо предоставления информации о способах связывания OP с активным сайтом различных вариантов PTE, данные раскрывают важность тегов, используемых для экспрессии белка, «выбора подходящих» условий кристаллизации, белковых конструкций и пространственных групп, а также их значение для разработки лекарственных препаратов на основе структуры.