Клиническая и медицинская биохимия

Абстрактный

Образование тетрасульфидного мостика (TTSB): необычная промежуточная структура в архитектуре и динамике молекулы gp120 ВИЧ-1

Гарри Ф. Кревкер

Gp120, одна из молекул, которая осуществляет проникновение вируса ВИЧ в клетки CD4+, имеет ряд аллостерических дисульфидных мостиков. В этом исследовании мы изучаем динамику этих потенциальных дисульфидных (дисульфидных) мостиков в трехмерной конфигурации (на основе кристаллографии) и анализы UNSW DBA различных кристаллов gp120. Данные показывают существование тетрасульфидного (тетрасульфидного) мостика (TTSB), который вместе с дисульфидным мостиком сохраняет два перпендикулярных бета-слоя (а именно V3 и V4) приближенными в архитектуре gp120, обеспечивая при этом безопасную передачу энергии между аллостерическими связями. Анализы нескольких кристаллов gp120 показывают, что существование TTSB является скорее промежуточным, а не постоянным ориентиром, что подразумевает более сложные функции, чем просто структурные атрибуты. Этот TTSB, который наблюдается в различных кристаллах gp120, в различных штаммах и кладах ВИЧ-1, демонстрируется различным программным обеспечением для рендеринга, а некоторые также обнаруживаются, сообщаются и характеризуются с помощью движка UNSW Disulfide Bond Analysis (DBA). Этот тетрасульфидный мостик соединяет аллостерическую связь Cys296-Cys331 с Cys385-Cys418, иногда как CYS331:SG-CYS385:SG, а иногда как CYS331:SG-CYS418:SG. Более того, в кристаллах 3TIH, 4LSR и 4R4N мы также наблюдали промежуточное состояние TTSB, где он представляет собой треугольное образование, в котором атом серы CYS331:SG связывается как с CYS385:SG, так и с CYS418:SG одновременно, что представляет собой важное промежуточное звено в функциональной динамике молекулы gp120. Наличие этой необычной структуры (TTSB) указывает на некоторые интригующие открытия в многофункциональной конструкции и механике, а также на некоторые сложные уязвимые места молекулы gp120, открывая новую мишень для противовирусной терапии.