Биохимия и аналитическая биохимия

Абстрактный

Борьба с устойчивой к антибиотикам Salmonella enterica: отбор на основе биоматрицы и прогнозирование биоактивности потенциальных нутрицевтиков

Анкит Танвар, Паллави Тхакур, Раман Чавла, Сарита Джайсвал, Анкита Сингх Чакотия, Раджив Гоэл, Ракеш Кумар Шарма, Хайдер Али Хан и Раджеш Арора

Цель: Потенциальные растительные препараты в качестве новых терапевтических альтернатив против Salmonella enterica serovar typhimurium с множественной лекарственной устойчивостью были исследованы и подтверждены компанией mol inspiration.

Методология: В настоящем исследовании используется модель in silico 'Herbal Informatics', которая использует динамические протоколы поиска, индексацию приоритетов и системную категоризацию для рационального выбора нутрицевтиков, нацеленных на критические факторы вирулентности Salmonella enterica serovar typhimurium с множественной лекарственной устойчивостью. Кроме того, in silico было проведено прогнозирование биохимической активности с использованием инструмента хемиинформатики 'Mol inspiration', чтобы предложить вероятность препарата для выбранных натуральных растительных продуктов.

Результаты: Из 05 выбранных параметров биологической активности Salmonella enterica ингибирование липополисахарида показало максимальную значимость в качестве физиологической цели, т. е. 65%, за ним следуют другие параметры, такие как ингибирование энтерохелина, ингибирование секреторной системы типа III, ингибирование супероксиддисмутазы и предоставление симптоматического облегчения. Анализ бинарной матрицы базы данных 50 растений, идентифицированных с помощью классической биопроспективы, отфильтровал 28 трав, которые продемонстрировали вероятный потенциал смягчения 03 или более факторов вирулентности. Анализ матрицы весов дополнительно изучил выборку до 10 трав, имеющих балл выше медианного балла матрицы весов, т. е. 14,98. Оптимизация данных по шкале от 0 до 1 с использованием анализа матрицы нечетких оценок привела к окончательному выбору 10 трав, а именно, Abrus precatorius, Azadirachta indica, Camellia sinensis, Holarrhena antidysenterica, Andrographis paniculata, Adhatoda vasica, Euphorbia hirta, Ocimum sanctum, Terminalia arjuna и Terminalia belerica. Анализ прогнозирования биоактивности in silico преобладающих фитокомпонентов выбранных трав выявил, что Holarrhena antidysenterica (конессин), Andrographis paniculata (андрографолид), Euphorbia hirta (амирин) и Terminalia arjuna (арджуноловая кислота) демонстрируют лекарственную схожесть с их целевым действием в качестве лиганда GPCR, лиганда ядерного рецептора или ингибитора протеазы .