Джадхао К.Р., Самал К.К., Прадхан С.К. и Рут Г.Р.
Ряд потенциальных генов-кандидатов (CG) был идентифицирован с помощью транскриптомных и трансгенных подходов, участвующих в адаптивных реакциях на засуху у злаков. Одним из этих генов, обеспечивающих устойчивость к засухе, является семейство генов DREB. Исследование генетической/аллельной изменчивости в семействе генов DREB является важной предпосылкой для лучшего понимания устойчивости к стрессу. Настоящее исследование направлено на изучение аллельной изменчивости в нуклеотидной последовательности в гене DREB различных сортов риса, необходимых для программы улучшения урожая. Для молекулярной характеристики и добычи аллелей использовались десять сортов риса, как горных, так и равнинных. Результаты показали, что ген DREB был обнаружен во всей протестированной зародышевой плазме и представлен в NCBI GenBank (номера доступа KF 545561 - KF 545569). Биоинформатический анализ показал, что 100-процентная идентичность с доменом связывания ДНК AP2 из 59 аминокислот, которые показали сохранение трех листов с 14-м валином и 19-м остатками глутаминовой кислоты. Домен AP2 предполагаемого белка DREB был обнаружен богатым аминокислотами аланином (17,6%) и аргинином (15,7%) с предсказанной молекулярной массой 5,89 кДа и изоэлектрической точкой (pI) 10,38. Отмечено, что нуклеотидные последовательности гена DREB были проверены с помощью анализа полиморфизма ДНК, из которых было идентифицировано 196 неизменных (мономорфных) и 8 вариабельных (полиморфных), т.е. сегрегирующих участков, включая 9 мутаций и 5 гаплотипов. Разнообразие гаплотипов (генов) составило 0,756; дисперсия и стандартное отклонение разнообразия составили 0,01678 и 0,130 соответственно. Результат показал, что сорт «Кхандагири» показал 97,5% сходства со всеми образцами гена DREB риса и 0,036% эволюционного расхождения с образцом AK121956, имеющимся в базе данных. Это могло усилить возможности гена DREB как фактора транскрипции и привести к лучшему принятию и устойчивости сорта во время засухи.