Журнал исследований и разработок в области аквакультуры

Абстрактный

Роль регуляции PmRab7 в инфекции WSSV и функциональная проверка малой молекулы как ингибитора ГТФазы PmRab7

Амрендра Кумар, Судханшу Шекхар и Сараванакумар А*

Синдром белых пятен (WSS) — это вирусное заболевание, которое представляет обширную угрозу для индустрии разведения креветок. Его вызывает бакуловирус синдрома белых пятен (WSSB). Креветки (P. monodon и L. vannamei) не способны защищать себя от «чужих» материалов и патогенов из-за менее выраженного адаптивного иммунного ответа. Поэтому настоящая работа была взята в качестве приоритетной для изучения регуляции транскрипта PmRab7, который может быть рецептором для WSSV (vP28) после воздействия ингибитора малой молекулы. Первоначально было проведено скрининг всего 70 малых молекул ГТФазы против трехмерной структуры PmRab7. Среди всех молекула CID 1067700 была выбрана для молекулярной стыковки (IFD) с PmRab7 в присутствии GTP, GDP и Mg++. Кроме того, малая молекула была добавлена ​​в состав корма для P. monodon, и транскрипционная регуляция PmRab7 была относительно количественно определена против IFN-α как генов домашнего хозяйства во время заражения WSSV. В настоящем документе мы идентифицировали ингибитор PmRab7, CID 1067700, путем нацеливания на домен связывания ДНК PmRab7 с использованием стратегии виртуального скрининга. CID 1067700 преимущественно подавляет активность ГТФазы, изменяя положения ГТФ и Mg++. Кроме того, CID 1067700 подавляет экспрессию целевых генов PmRab7 ниже по течению, таким образом, CID 1067700 представляет собой новые зонды для разработки специфических ингибиторов, нацеленных на домен связывания ДНК PmRab7, и потенциального терапевтического средства против WSSV. Существенные изменения наблюдались в регуляции PmRab7 и размножении WSSV в первоначальном испытании CID 106700. CID 106700 приводит к успешной инактивации PmRab7 путем изменения положений ГТФ и Mg++. Регуляция PmRab7 была увеличена в 5-8 раз в течение 72 часов после заражения. Замена GTP малыми молекулами выявила значительное снижение регуляции гена PmRab7 во время инфекции WSSV. Примечательно, что вирусная нагрузка (абсолютно определенная количественно) также была обнаружена сниженной, когда PmRab7 был подавлен. Интернализация WSSV напрямую связана с регуляцией PmRab7.