Журнал микробных и биохимических технологий

Абстрактный

Извлечение РНК из дрожжей Candida parapsilosis Sensu Stricto с использованием двух коммерческих методов, основанных на очистке с помощью колонок с силикагелем

Родригес МЛ, Роза АС и Евтухович ВМ

Для изучения экспрессии генов необходимо получить РНК хорошего качества. Были описаны различные методы извлечения РНК, но качество и выход РНК могут различаться в зависимости от различных методов и биологических видов исследования. На сегодняшний день не существует стандартизированного метода извлечения и очистки РНК из дрожжей рода Candida . Немногочисленные доступные статьи по этой теме относятся в основном к нитчатым грибам и дали плохие результаты для методов извлечения, основанных на ручных или внутренних методах IVD. Поэтому целью данного исследования было сравнить две коммерческие системы извлечения и очистки РНК с использованием колонок с силикагелем (Qiagen и Zymo Research) с Candida parapsilosis sensu stricto в качестве модельного организма. Эти дрожжи были идентифицированы в недавних статьях как второй по частоте изолируемый вид Candida в полости рта. В последнее десятилетие они стали объектом растущего медицинского интереса, поскольку являются одной из основных причин кандидемии как у взрослых, так и у недоношенных новорожденных. В связи с этим фоном мы считаем изучение транскриптома Candida parapsilosis sensu stricto и его изменений в зависимости от изменений окружающей среды приоритетным. В этом экспериментальном исследовании 19 грибковых изолятов были обработаны с помощью Qiagen и 17 изолятов — с помощью Zymo Research. Результаты показывают, что буфер лизиса Qiagen RLT необходим для получения более качественного продукта РНК.