Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Геномная дактилоскопия методом ПЦР выявила генетическое разнообразие и структуру популяции среди эфиопских изолятов Pseudocercospora griseola, возбудителя фасоли обыкновенной ( Phaseolus vulgaris L.)

Яис Резене, Кассахун Тесфайе, Муканкуси Клэр, Аллан Мэйл и Пол Гептс

Угловая пятнистость листьев ( Pseudocercospora griseola ) является одним из самых разрушительных заболеваний, поражающих производство фасоли обыкновенной в большинстве районов Эфиопии. Таким образом, использование сортов фасоли обыкновенной с устойчивой устойчивостью является наиболее эффективной и экономичной мерой контроля. Знания о генетической изменчивости и популяционной структуре популяций патогенов важны для успешной программы улучшения фасоли обыкновенной. Целью данного исследования было определение геномного разнообразия, существующего среди и между изолятами P. griseola , которые были получены из полевых исследований различных районов выращивания фасоли обыкновенной в Эфиопии. В исследовании использовался протокол полимеразной цепной реакции с повторяющимися экстрагенными палиндромными элементами для фингерпринтинга разнообразия последовательностей ДНК. Для изучения генетического разнообразия мы проанализировали молекулярные данные из 79 односпоровых изолятов патогена P. griseola . Таким образом, молекулярный дисперсионный анализ (AMOVA) и кластерный анализ выявили существование высокого генетического разнообразия внутри и между изолятами P. griseola . ERIC PCR дал 21 различный образец кластеров, тогда как REP-PCR и BOX PCR дали 11 и 5 разных образцов кластеров соответственно. Это связано с тем, что некоторые изоляты, которые разделяли одинаковые образцы BOX, можно было различить по образцам отпечатков пальцев ERIC и REP. Комбинированные образцы отпечатков пальцев ERIC, BOX и REP-PCR распознали 25 разных образцов среди 79 моноспоровых изолятов P. griseola , которые были получены при 77%-ном пороговом значении матрицы генетического сходства. Эти различенные кластеры выявили наличие генетического разнообразия внутри и среди изолятов P. griseola, собранных из различных регионов выращивания фасоли в Эфиопии.