Генная технология

Абстрактный

Регуляция экспрессии VEGF-A в эндотелиальных клетках путем активации транскрипционных генов или подавления транскрипционных генов: анализ транскрипционного ответа по всему геному

Тия Хуссо, Микко П. Турунен и Сеппо Ила-Херттуала

Фактор роста эндотелия сосудов (VEGF-A) является важным геном во многих заболеваниях, таких как рак и сердечно-сосудистые заболевания. Мы исследовали изменения в моделях экспрессии генов по всему геному в эндотелиальных клетках мышей, когда экспрессия VEGF-A была эпигенетически модулирована с использованием малых шпилечных РНК (shRNA), нацеленных на промоторы. Эндотелиальные клетки мышей были трансдуцированы лентивирусными векторами, экспрессирующими shRNA, которые комплементарны промотору гена. Эксперименты с массивом экспрессии генов были проведены для изучения изменений экспрессии мРНК по всему геному, вызванных повышением и понижением регуляции VEGF-A. Было несколько сотен дифференциально экспрессируемых генов в соответствии с примененными статистическими критериями. Мы заметили, что эффекты понижения регуляции VEGF-A были гораздо более распространены, чем эффекты повышения регуляции VEGF-A. Наш анализ in silico показал, что ряд различных биологических процессов изменяется из-за эпигенетических эффектов на экспрессию VEGF-A. Было обнаружено, что одним из основных регуляторов транскрипционного ответа, опосредованного VEGF-A, является фактор транскрипции ATF-4. Это первое исследование, показывающее транскрипционный ответ на эпигенетическую модификацию экспрессии VEGF-A в эндотелиальных клетках. Эпигенетическая регуляция генов представляет собой естественный механизм регуляции генов, и эти результаты раскрывают ранее неизвестные последствия регуляции VEGF-A в эндотелиальных клетках.