Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Быстрое обнаружение и количественное определение Fusarium udum в образцах почвы и растений с использованием ПЦР в реальном времени

Сукумар Месапогу, Бандамаравури Кишор Бабу, Ачала Бакши, Сомасани С. Редди, Сангита Саксена, Алок К. Шривастава и Дилип К. Арора

Анализ обнаружения на основе ПЦР в реальном времени был разработан для Fusarium udum, вызывающего сосудистое увядание голубиного гороха. Ген гистона-3 F. udum был нацелен на разработку видоспецифичных праймеров и зонда. Было проведено сравнительное исследование для разработки надежной и воспроизводимой процедуры обнаружения и количественной оценки F. udum из различных образцов. Чувствительность и специфичность олигонуклеотидов оценивались с помощью гибридизации дот-блоттинга, стандартного и реального времени ПЦР-анализов. Зонд HFUSP показал высокую степень чувствительности ДНК, полученной из чистых культур F. udum, к ДНК образцов окружающей среды. Анализ qPCR специфически дифференцировал F. udum от близкородственных видов Fusarium, других тестовых микробов и образцов окружающей среды. Единая кривая плавления при 84,17 и мономорфная полоса в 200 п.н. указывают на специфичность и подлинность анализов ПЦР. Таким образом, анализ ПЦР в реальном времени может быть использован в качестве быстрой и эффективной процедуры, которая может обнаружить мельчайшие количества F. udum из сложных сред. Таким образом, анализ ПЦР в реальном времени, продемонстрированный в настоящем исследовании, может быть успешно использован для обнаружения и мониторинга F. udum для ранней инфекции и эпидемиологии заболевания сосудистым увяданием голубиного гороха.