Венфа Нг*
Давление эволюционного отбора или наличие склонной к ошибкам полимеразы в вирусе приведет к появлению вариантов, которые являются более заразными или более смертоносными. Но разные гены кодируют белки с разными функциями в патогенном процессе вируса и, таким образом, подвергаются разному давлению эволюционного отбора. Это обязательно приводит к разным частотам мутаций, которые имеют последствия для эволюции вируса и связанного с ним патогенного потенциала. Эта работа была направлена на определение предварительной оценки частоты мутаций каждого гена в геноме SARSCoV-2 с использованием 10 собранных геномов, депонированных в Европейском архиве нуклеотидов. Результаты показывают, что обычно мутируют пять генов. В частности, эти гены представляют собой РНК-зависимую РНК-полимеразу, спайковый белок, ORF3a , ORF8 и нуклеокапсидный белок. В частности, РНК-зависимая РНК-полимераза и спайковый белок имеют самую высокую частоту мутаций - 90%, за ними следуют ORF3a (30%), нуклеокапсидный белок (20%) и белок ORF8 (10%). В целом, оценка частот мутаций каждого гена в геноме вируса дает критически важные знания для корреляции тяжести заболевания с генотипом, а также для понимания эпидемиологического профиля вируса. Такие усилия в SARS-CoV-2, предпринятые в этой работе, выявили, что спайковый белок и РНК-зависимая РНК-полимераза имеют самую высокую частоту мутаций, что коррелирует с опубликованным частым появлением вариантов, вызывающих беспокойство, в разных частях мира.