Гомасе В.С., Читланге Н.Р., Шерхане А.С., Чангбхале СС и Кале КВ.
Wuchereria bancrofti — нитевидная нематода, один из возбудителей лимфатического филяриатоза, при котором
лимфатические и половые органы временно или постоянно повреждаются; до настоящего времени не было обнаружено эффективного препарата или вакцины для лечения лимфатического филяриатоза. В этом анализе мы предсказали антигенные пептиды из тропонинового белка Wuchereria bancrofti для разработки синтетической пептидной вакцины против лимфатического филяриатоза, поскольку с помощью одной белковой субъединицы можно вызвать иммунный ответ в большой популяции. Анализ показывает, что предсказанные эпитопы тропонинового белка Wuchereria bancrofti являются важными детерминантами для защиты от лимфатического филяриатоза. В этом анализе мы проанализировали сродство связывания тропонинового белка Wuchereria bancrofti, имеющего 136 аминокислот, что показывает 128 нонамеров. В этой исследовательской работе мы предсказали CTL-эпитопы двумя различными методами, а именно SVM (машина опорных векторов) и ANN (искусственная нейронная сеть), прогноз на основе SVM показал шестнадцать действительных эпитопов с оптимальной оценкой 1,129 при пороговом значении 0,36, тогда как прогноз на основе ANN показал тридцать один действительный эпитоп с оптимальной оценкой 1,000 при пороговом значении 0,51. Мы также предсказали каскадные связыватели TAP на основе SVM и четыре потенциальных антигенных эпитопа, как, 31-LRKLIRK-37, 49-DEFCALVYTVANT-61, 87-SRPTLKALLKE-97, 108-EAAVDE-113 (оптимальная склонность 1,223), предсказанные на основе самой высокой локальной гидрофильности; В дополнение к этому мы также экспериментально предсказали третичную структуру двух самых длинных потенциальных эпитопов, которые могут помочь нашему пониманию
взаимосвязи последовательности-структуры-функции тропонинового белка Wuchereria bancrofti по отношению к разработке синтетической пептидной вакцины. Таким образом, небольшой фрагмент тропонинового белка может вызывать иммунный ответ против активности Wuchereria bancrofti. Этот подход может быть применен для разработки субъединичных и синтетических пептидных вакцин.