Журнал интеллектуального анализа данных в геномике и протеомике

Абстрактный

Прогнозирование микроРНК против белков H5N1 и H1N1 NS1: окно в разработку терапевтических средств, специфичных для секвенирования

Панкадж Копарде и Шайлза Сингх

Мотивация: Традиционные препараты от гриппа могут привести к неэффективности из-за высокой изменчивости природы антигенных белков гриппа. Прогнозирование in silico последовательно-специфических терапевтических средств занимает меньше времени и является экономически эффективным. Большинство платформ прогнозирования целевых miRNA отличаются по своей специфичности и чувствительности в прогнозировании. Здесь мы предлагаем биоинформатический подход для прогнозирования микроРНК против неструктурного белка 1 вируса птичьего гриппа H5N1 и против вируса свиного гриппа H1N1 сегмента 8.

Результаты: hsa-miR-138, hsa-miR-525-5p и hsa-miR-124 были отсортированы как потенциальные терапевтические агенты, специфичные к последовательности, против белка NS1 вируса H5N1. Аналогичные исследования различных геномов H1N1 сегмента 8 привели к предсказанию miRNA, которые могут быть использованы в качестве противогриппозных агентов. Предсказанные микроРНК также играют роль в регуляторных процессах клетки-хозяина, путях, связанных со стрессом, включая путь MAPK, путь mTOR, и, как обнаружено, участвуют в путях, связанных с раком.