Журнал интеллектуального анализа данных в геномике и протеомике

Абстрактный

Прогнозирование трехмерной структуры паралитического инсектицидного токсина (ITX-1) Tegenaria agrestis (паук-бродяга)

AGIngale и NJChikhale

Паралитический инсектицидный токсин (ITX-1) (Tegenaria agrestis) включает несколько антигенных компонентов для направления и усиления иммунной системы для защиты хозяина от инфекции. Пептидные токсины паука с наномолярным сродством к их рецепторам являются перспективными фармакологическими инструментами для понимания физиологической роли ионных каналов и в качестве зацепок для разработки новых терапевтических средств и стратегий для заболеваний, связанных с ионными каналами. Была разработана трехмерная модель (3D) для паралитического инсектицидного токсина (ITX-1) Tegenaria agrestis (паук-бродяга). Для прогнозирования структуры использовался метод моделирования гомологии. Для моделирования был получен шаблонный белок с помощью mGenTHERADER, а именно структура рентгеновской кристаллографии высокого разрешения ФЕРРЕДОКСИНА (1FCA) Clostridium acidurici. Сравнивая шаблонный белок, была построена грубая модель для целевого белка с помощью MODELLER, программы для сравнительного моделирования. Модель была проверена с использованием инструментов проверки структуры белка, таких как PROCHECK и WHAT IF, для надежности. Информация, обсуждаемая таким образом, дает представление о молекулярном понимании паралитического инсектицидного токсина (Tegenaria agrestis). Предсказанная 3-D модель может быть далее использована для характеристики белка во влажной лаборатории.