Журнал науки о старении

Абстрактный

Исследование POOL-SEQ среди долгожителей Болгарии подчеркивает важность путей экспрессии генов для продолжительности жизни человека

Димитр Сербезов, Любомир Балабански, Сена Карачанак-Янкова, Радослава Важарова, Десислава Нешева, Зора Хаммудэ, Рада Станева, Марта Михайлова, Вера Дамьянова, Ольга Антонова, Драгомира Николова, Савина Хаджидекова, Драга Тончева

В исследованиях долголетия человека было выявлено большое количество генетических вариантов с небольшими эффектами, но их нелегко воспроизвести в разных популяциях. Мы провели секвенирование всего экзома двух пулов ДНК: 32 болгарских долгожителей и 61 молодого здорового контрольного образца соответственно. Было обнаружено в общей сложности 59935 отфильтрованных вариантов, 216 из которых были включены в базу данных Longevity Map, в которой перечислены 2843 варианта, связанных с долголетием. Используя точный тест Фишера, 22 из этих вариантов показали значительно более высокую частоту аллелей у долгожителей по сравнению с контрольным пулом и, таким образом, положительно связаны с долголетием. Другие 24 варианта имели значительно более высокую частоту в контрольной группе и могли считаться отрицательно связанными с долголетием. Аллель риска C в rs429358 гена APOE был обнаружен только в контрольном пуле и с более низкой частотой по сравнению с другими популяциями. Анализы REACTOME показали, что чрезмерно представленные пути с положительными вариантами долголетия принадлежат к сети экспрессии/транскрипции с ведущей ролью TP53, взаимодействующей с другими генами (ATR, FANCD2, BAX, BRIP1), тогда как пути с отрицательными вариантами долголетия принадлежат к сети передачи сигнала. Наши результаты подтверждают важность изучения долгожителей в разных популяциях для обнаружения тех комбинаций вариантов, которые связаны с более длительной продолжительностью здоровья.