Журнал бактериологии и паразитологии

Абстрактный

Филогенетическая группировка доминирующих фекальных изолятов Escherichia coli от здоровых мужчин и женщин в провинции Аль-Кут/Васит/Ирак

Сареаа М.Г. Аль-Маяхи, Алаа А.М. Аль-Хафаджи, Нуха А.С. Дош, Асель Р.К. Аль-Рекаби и Ахлам Г.Н. Аль-Атаби

Фекальные изоляты Escherichia coli делятся на четыре основные филогенетические группы, обозначенные как A, B1, B2 и D. Большинство комменсальных штаммов относятся к группе A и имеют меньше факторов вирулентности, чем внекишечные патогенные штаммы E. coli (ExPEC). Это исследование было в основном разработано для филогенетической группировки комменсальных фекальных изолятов E. coli от здоровых мужчин и женщин в городе Аль-Кут/провинция Васит/Ирак с использованием протоколов на основе ПЦР. Также среди этих изолятов были обнаружены гены вирулентности ExPEC. Среди включенных в это исследование изолятов (n=205) группа A была наиболее распространенной среди как женских, так и мужских изолятов (68,5% против 63,0% соответственно), за ней следовали группы: B1 (15,7% против 22,6% соответственно), D (10,7% против 9,5% соответственно) и B2 (4,1% против 4,7% соответственно). Гендерное распределение филогенетических групп показало незначительные различия между самками и самцами. Изоляты самок и самцов существенно не различались по всем обнаруженным генам вирулентности ExPEC, за исключением papC, который был значительно (P ≤ 0,05) более распространен среди мужских изолятов (16,6%), чем среди женских изолятов (6,6%). В изолятах как самок, так и самцов наиболее распространенными генами вирулентности были fimH (97,5% против 100% соответственно) и iucC (52,0% против 55,9% соответственно), тогда как наименее распространенными были sfa/foc (по 0% каждый) и hly (0,82% против 0% соответственно). Кроме того, гены вирулентности были сконцентрированы в изолятах, сгруппированных в группе B2.
Как у самок, так и у самцов, высокий процент доминирующих комменсальных фекальных изолятов E. coli от иракцев в городе Аль-Кут был сгруппирован в филогруппе A, за которой следовали группы B1 и D, тогда как группа B2 была редкой. Кроме того, доминирующие фекальные штаммы с характеристиками ExPEC были гораздо менее распространены.