Журнал бактериологии и паразитологии

Абстрактный

Фенотипические и генотипические различия в инвазивных и неинвазивных штаммах Streptococcus pneumoniae

Фариха Алтааф*, Аббас Мухаммад

Streptococcus pneumoniae ( S. pneumoniae ) является человеческим патогеном и основной причиной смертности и заболеваемости во всем мире. Streptococcus pneumoniae является возбудителем отита среднего уха, пневмонии, менингита и бактериемии. Дети, пожилые люди и пациенты с ослабленной иммунной системой подвергаются более высокому риску заражения этими бактериями. Согласно иммунохимии их капсульного полисахарида, S. pneumoniae разделяется на более чем 90 серотипов. Многие поверхностные белки присутствуют на S. pneumoniae, например, поверхностный белок А, пневмолицин, гиалуронатлиаза и т. д. Капсула является основным вирулентным фактором для пневмококков и предотвращает фагоцитоз бактерий иммунной системой хозяина. Некоторые антигенные детерминанты также изучались на предмет их потенциала вызывать защитный иммунный ответ в различных клинических испытаниях и экспериментах. Популяционная биология S. pneumoniae плохо изучена. Большинство проблем возникает из-за молекулярной характеристики, хорошо отобранной популяции от носительства и от различных пневмококковых заболеваний-раскрывателей. Для решения этой проблемы были разработаны схема и база данных мультилокусного типирования последовательностей путем секвенирования фрагментов 450 п.н. семи локусов домашнего хозяйства из 295 изолятов. Аллельная комбинация семи локусов дает тип последовательности или аллельный профиль. Эта схема типирования была проверена с использованием пневмококков с известным генетическим родством и может разрешить >6 миллиардов типов последовательностей. Схема мультилокусного типирования последовательностей выделяет новый мощный подход к характеристике пневмококков, поскольку она предоставляет данные молекулярного типирования, которые можно переносить в электронном виде между лабораториями и которые можно использовать для исследования аспектов популяции и эволюционной биологии этих организмов. В этом проекте мы сравнили два разных штамма S.pneumoniae, чтобы проверить, какой из них быстро растет, и наблюдали разницу между инвазивными и неинвазивными штаммами на основе фенотипа и генотипа.