Журнал исследований и разработок в области аквакультуры

Абстрактный

Фенотипическая и генотипическая характеристика некоторых видов Pseudomonas sp., связанных с Burkholderia cepacia, выделенных из различных инфицированных рыб

Манал И Эль-Барбари и Ахмед М Хал

Целью данного исследования является характеристика видов Pseudomonas, выделенных из различных естественно больных пресноводных и морских рыб, нильской тиляпии, сома, леща-золотистого и морского окуня, с использованием фенотипического метода, морфологических и биохимических признаков с использованием API 20NE и генотипического метода (секвенирование гена 16S рРНК) с некоторыми гистопатологическими характеристиками. Шесть из семи предполагаемых Pseudomonas sp. были успешно идентифицированы методом API 20NE для выравнивания видов; они были идентифицированы как 2 P. fluorescens, один P. putida, один Pseudomonas sp и 3 Burkholderia cepacia, в то время как генотипически с секвенированием гена 16S рРНК, которое оказалось успешным для всех четырех изолятов псевдомонад (три как P. fluorescens и один P. putida). Результаты филогенетического анализа поместили изоляты в род Pseudomonas на основе 99% гомологии. Испытательный тест показал, что P. fluorescens и P. putida следует классифицировать как патогенные для O. niloticus, и они также проявляли клинические признаки и показатели смертности до 70% и показали гистопатологические изменения как печени, так и почек, которые привели к смерти. Исследование антибиотикограммы показало, что нет существенных различий между P. fluorescens и P. putida, которые имели изначально высокую чувствительность к ингибиторам синтеза нуклеиновых кислот, таким как ципрофлоксацин, норфлоксацин, гентамицин, гатифлоксацин, ломефлоксацин и канамицин. В результате исследования был сделан вывод о том, что для изолятов было обнаружено хорошее общее соответствие между процедурами фенотипической и генотипической идентификации, при этом между штаммами P. fluorescens наблюдались некоторые незначительные различия в биохимических и физиологических характеристиках, в то время как между P. fluorescens и P. putida, выделенными из разных рыб, наблюдались значительные генотипические различия.