Генная технология

Абстрактный

Фенотипическая и генотипическая характеристика Carnobacterium divergens, выделенных из охлажденного тунисского рубленого сырого говяжьего мяса

Турая Мокрани, Инес Эссид, Мнасер Хассуна, Лаххеб Джихене, Грам Абдельджалил и Ахлем Джуини

Шесть психотропных штаммов Carnobacterium divergens были выделены из тунисского рубленого сырого говяжьего мяса, упакованного и хранящегося при температуре 6 °C. Сначала они были идентифицированы биохимическими методами. С использованием биохимических реакций и ферментации углеводов перед их характеристикой молекулярными методами. Штамм Carnobacterium divergens представляет собой неподвижную грамположительную психотропную палочку, в которой отсутствуют каталаза, оксидаза и маннит. Он растет при pH 9,1 (агар D-MRS), но не на ацетатном агаре (pH ≤ 5,4). Для всех этих изолятов фенотипическая идентификация с использованием системы API 50 CHL выявила изменчивость в ферментативных способностях некоторых сахаров (глицерина, амигдалина, арбутина, D-трегалозы и глюконата калия). Для обеспечения идентификации этих изолированных штаммов на уровне вида использовались видоспецифичные праймеры полимеразной цепной реакции (ПЦР). Более того, секвенирование гена 16S рРНК подтвердило, что все шесть изолятов идентифицированы как C. divergens. Метод Rep-PCR был применен для исследования внутривидового разнообразия в пределах этих шести штаммов C. divergens, обычно идентифицируемых в мясе. Метод Rep-PCR различил штаммы C. divergens, продемонстрировав их биоразнообразие и их очевидное сходство. Праймеры BOX и REP позволили провести амплификацию с 85% и 80% сходства между штаммами соответственно. Было доказано, что праймеры BOXA1R и REP полезны для дифференциации штаммов C. divergens.