Журнал биоэквивалентности и биодоступности

Абстрактный

Оптимизация свинца на основе фармакофоров и молекулярный стыковочный анализ для обнаружения сильного ингибитора белка HCRTR2

Марьям Макбул*

Бессонница является растущей проблемой общественного здравоохранения, поскольку ее распространенность растет с каждым днем. Это одно из самых распространенных расстройств сна среди азиатов. Каждый 1 из 10 человек, страдающих бессонницей, страдает бессонницей. Среди всех расстройств сна около 6-10% соответствуют критериям бессонницы. Это очень часто встречается у женщин по сравнению с мужчинами. В этой исследовательской работе мы сосредоточены на идентификации потенциального целевого препарата для обеспечения эффективного лечения с помощью лекарственных растений. В этом исследовании использовался подход фармакофора на основе лиганда с последующим молекулярным докингом и виртуальным скринингом. Сервер Protox использовался для прогнозирования класса токсичности. Молекулярные свойства химического компонента, обладающего свойствами против бессонницы, проверялись с помощью Swiss ADME, инструмента прогнозирования свойств ADMET и инструмента обозревателя свойств Osiris. Фармакофор на основе лигандов четырех соединений Osmium basilicum был выполнен, затем проведен скрининг в библиотеках Zinc, Princeton и Drug Bank с использованием лигандного разведчика, затем соединения с более высоким показателем соответствия фармакофору с CID NS_013367, NS_005529, NS_007342, NS_011378 и NS_011361. Для стыковки было выбрано NS_011285. Молекулярная стыковка была выполнена для желаемого целевого белка HCRTR2 с проверенными соединениями по одному с помощью Autodockvena, а затем лучшая поза, показывающая лучший угол ориентации местоположения, была выбрана для дальнейшего исследования, которое демонстрирует минимальную энергию связывания, а результаты стыковки были проанализированы с помощью Pymol и Discovery Studio. Соединение с номером CID NS_011285 обладает лучшей позой и более низкой энергией связывания -9,4 по сравнению с другими соединениями. Двумерная структура показывает взаимодействие MET, VAL, LEU, PHE и ARG 2D аминокислоты с мутированным белком HCRTR2 и типом взаимодействий, таким как алкил, Pi-алкил, Pi-сигма и Pi-сера. Наконец, мы определили лиганд, который обладает наилучшими свойствами сходства с лекарственным средством и потенциалом для ингибирования активности HCRTR2, которая является основным виновником расстройства бессонницы.