Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Патогенетическая и генетическая характеристика рас Xanthomonas campestris Pv. campestris на основе Rep-PCR и анализа мультилокусной последовательности

Приянка Сингх Ратхаур, Динеш Сингх, Рича Рагхуванши и Ядава Д.К.

Xanthomonas campestris pv. campestris (Pammel) Dowson (Xcc) является возбудителем черной гнили крестоцветных во всем мире. Семьдесят пять изолятов Xcc были собраны из 12 агроклиматических регионов Индии для определения характера распределения рас и разнообразия популяции. На основе патогенной реакции на семи стандартных дифференциальных крестоцветных было обнаружено, что преобладающими являются расы 1, 4 и 6. Для оценки патогенного разнообразия сорок один сорт крестоцветных, включающий семь видов Brassica и coeno, был искусственно инокулирован в полевых условиях. Сорта Brassica juncea (Pusa Bold, Varuna, Pusa Vijay, Pusa Mustard 21 и Pusa Mustard 25) показали устойчивость ко всем штаммам Xcc, тогда как сорт Brassica olerecea Pusa Ageti оказался устойчивым к расам 1 и 4. Генетическая характеристика этих 75 штаммов Xcc была проведена с использованием rep-PCR (ERIC, REP и BOXPCR) с последующим филогенетическим анализом. Штаммы Xcc были сгруппированы в 6 групп с коэффициентом сходства 50%, и среди этих групп 28 штаммов Xcc, принадлежащих к расам 1, 4 и 6, были сгруппированы вместе в группу 5. Последовательности генов 16S рРНК, hrpF и efP пяти штаммов, представляющих расы 1, 4 и 6, были использованы для анализа мультилокусной последовательности. На основании анализа последовательности генов 16S рРНК и hrpF было обнаружено, что индийские штаммы очень тесно связаны со штаммом Xcc ATCC 33913 (раса 3, Великобритания), тогда как на основании последовательностей efP было обнаружено, что они тесно связаны со штаммами расы 1 Xcc B100 (Италия) и расы 9 Xcc 8004 (Великобритания).