Журнал микробных и биохимических технологий

Абстрактный

Оптимизация метода экстракции для метаболомики на основе ГХ-МС для мицелиальных грибов

Сирибхорн Мадла, Дайсуке Миура и Хироюки Вариси

Извлечение метаболитов считается одним из наиболее важных этапов контроля качества в метаболомных исследованиях. В настоящем исследовании был изучен оптимальный протокол извлечения для внутриклеточных метаболитов грибов. Были сравнены два протокола извлечения с различными системами растворителей, извлечение метанолом и двухфазная экстракция при различных условиях pH. В качестве критериев учитывались количество обнаруженных пиков, вариация от образца к образцу и производительность всего процесса. Извлеченные метаболиты анализировались с помощью газовой хроматографии-масс-спектрометрии (ГХ-МС) и анализа главных компонентов (PCA). Протокол извлечения с использованием метанола в качестве экстракционного растворителя обеспечил наибольшее количество обнаруженных пиков (~ 300 пиков) с легкостью и скоростью, что позволяет предположить, что метод извлечения метанолом подходит для извлечения внутриклеточных метаболитов из P. chrysosporium. Однако, в зависимости от природы интересующих метаболитов, двухфазный метод извлечения при различных условиях pH подходит для целевого анализа.