Клиники по охране здоровья матери и ребенка

Абстрактный

Неинвазивное пренатальное тестирование анеуплоидий плода с использованием нового метода, основанного на цифровой капельной ПЦР и бесклеточной фетальной ДНК

Ван Хайдун, Ян Чжицзе, Ван Юсян, Джан Карло Ди Ренцо, Елена Пиккьяси, Федерика Тарквини, Джулиана Коата, Ван Ю, Чэнь Юй

Предыстория: Текущее секвенирование следующего поколения (NGS) и неинвазивные пренатальные тесты на основе микрочипов (NIPT), используемые для обнаружения распространенных трисомий плода, по-прежнему дороги, требуют много времени и должны проводиться в централизованных лабораториях. Чтобы улучшить NIPT в клинической рутинной практике в качестве универсального пренатального скрининга, мы разработали анализ на основе цифровой капельной ПЦР (ddPCR), называемый iSAFE NIPT, с использованием бесклеточной фетальной ДНК (cffDNA) для обнаружения трисомий плода 13, 18 и 21 в одной реакции с преимуществом высокой диагностической точности и сниженной стоимости.

Материалы и методы: Сначала мы использовали образцы искусственной ДНК для оценки аналитической чувствительности и специфичности iSAFE NIPT. Затем мы проанализировали 269 образцов плазмы для клинической валидации iSAFE NIPT. Пятьдесят восемь из них, включая пять трисомий 21, две трисомии 18 и одну трисомию 13, были использованы для установления пороговых значений анализа на основе соотношений между числами хромосом. Остальные 211 образцов плазмы, включая 10 трисомий 21, были проанализированы для оценки клинической эффективности iSAFE NIPT.

Результаты: iSAFE NIPT достиг 100% аналитической чувствительности (95% ДИ 94,9–100% трисомия 21; 79,4–100% трисомия 18; 73,5–100% трисомия 13) и 100% специфичности (95% ДИ 96,3–100% трисомия 21; 97,6–100% трисомия 18; 97,6–100% трисомия 13). Он также достиг 100% клинической чувствительности и специфичности для обнаружения трисомии 21 в 211 клинических образцах (95% ДИ для чувствительности составляет 69,1–100%, а 95% ДИ для специфичности составляет 98,2–100%).

Заключение: iSAFE NIPT — это высокомультиплексный анализ на основе ddPCR для обнаружения трисомий плода в крови матери. Согласно клинической валидации, iSAFE NIPT обладает высокой диагностической чувствительностью и специфичностью. Его можно децентрализованно использовать в обычных клинических лабораториях, он быстрый, простой в использовании и экономичный по сравнению с текущим NIPT.