Журнал исследований и терапии стволовых клеток

Абстрактный

Новое программное обеспечение для регистрации мультимодальных изображений с применением в исследованиях по отслеживанию клеток

Дитц Б, Александр М, Эльхами Э, Сян Б, Дэн Дж, Ван Ф, Чи С, Герцен А.Л., Мзенгеза С., Фрид Д., Арора Р.К. и Тиан Дж.

Позитронно-эмиссионная томография (ПЭТ) является важным инструментом для молекулярной визуализации in vivo благодаря своей высокой чувствительности. В сочетании с непревзойденным контрастом мягких тканей магнитно-резонансной томографии (МРТ) ПЭТ-МРТ позволяет проводить точную количественную оценку, необходимую для исследований отслеживания клеток. Целью данного исследования является разработка программы регистрации изображений на основе ориентиров, способной выполнять регистрацию реперных точек, для применения в исследовании отслеживания стволовых клеток. Изображения ПЭТ и МРТ, полученные с использованием реперных маркеров, расположенных в поле зрения вокруг образца, регистрировались с помощью нашей программы на основе ориентиров, написанной в Matlab. Реперные маркеры также использовались для проверки точности нашей программы Matlab, наряду с другим программным обеспечением для автоматизированной регистрации изображений, включая: автоматическую регистрацию изображений (AIR), инструмент регистрации линейных изображений FMRIB (FLIRT) и обработку, анализ и визуализацию медицинских изображений (MIPAV), все они доступны онлайн бесплатно для загрузки. Все программы смогли успешно зарегистрировать изображения; Однако наша программа Matlab обеспечила наилучшую точность регистрации с ошибкой регистрации (FRE) 1,36 мм. Наша программа, разработанная Matlab, доступна для бесплатной загрузки по адресу www.sourceforge.net/p/matlabaffinereg.