Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Молекулярное определение и характеристика гена рРНК 16S фитоплазмы в отдельных диких травах Западной Кении

Адам О.Дж., Midega CAO, Руно С. и Хан З.Р.

Производство перистощетинников пурпурных (Pennisetum purpuruem) для систем нулевого выпаса сократилось до 90% на многих мелких полях из-за болезни карликовости перистощетинковых трав (Ns), вызванной фитоплазмой подгруппы 16SrXI в западной Кении. Предполагается, что несколько других диких трав в Кении могут быть заражены фитоплазмами, которые в противном случае представляли бы значительную угрозу для перистотканных трав, других важных кормовых и продовольственных культур. Поэтому это исследование было направлено на обнаружение и идентификацию штаммов фитоплазм, заражающих дикие травы в западной Кении, с использованием гена рибосомальной РНК (рибонуклеиновой кислоты) 16S, а также на выявление видов диких трав, содержащих фитоплазмы, в 646 образцах диких трав, которые были собраны в октябре 2011 года и январе 2012 года во время случайного перекрестного обследования, проведенного в округах Бунгома и Бусиа в западной Кении. ДНК была извлечена, и для обнаружения фитоплазм использовалась реакция гнездовой полимеразы (nPCR). Две подгруппы фитоплазм были обнаружены в восьми видах трав, которые, как наблюдалось, росли вблизи зараженных полей Napier. Только одна из двух зарегистрированных фитоплазм была связана с фитоплазмой Ns. Была выявлена ​​сильная связь между пропорциями заражения фитоплазмой и видами собранных трав (p = 0,001). C. dactylon, D. scalarum, B. brizantha, poor grass и P. maximum имели высокие пропорции заражения и были широко распространены в западной Кении, поэтому считались дикими хозяевами фитоплазмы. E. indica и C. ciliaris были мало распространены и имели низкие показатели заражения. Была статистически значимая разница в пропорциях заражения в зависимости от места обследования (p = 0,001). Подгруппы фитоплазмы 16SrXI и 16SrXIV были единственными генотипами фитоплазмы, распространенными среди диких трав в западной Кении. Подгруппа фитоплазм 16SrXIV преимущественно заражает только злаки C. dactylon и B. brizantha, тогда как подгруппа фитоплазм 16SrXI имеет широкий спектр и заражает большое количество диких злаков. В целом, в западной Кении существует разнообразие диких злаков, являющихся хозяевами фитоплазм. Эти злаки-хозяева могут быть причиной высоких показателей, наблюдаемых при распространении болезни Ns в западной Кении, выступая в качестве резервуаров для фитоплазмы Ns.