Эман Ибрагим, Ким Д. Джонс, Эбтесам Н. Хосенья
0Лигноцеллюлозная биомасса имеет потенциал для биоэтанола, возобновляемого топлива. Ограничением является то, что биоконверсия сложного лигноцеллюлозного материала в простые сахара, а затем в биоэтанол является сложным процессом. Недавние работы были сосредоточены на генной инженерии биокатализатора, который может играть решающую роль в производстве биотоплива. Escherichia coli считалась удобным хозяином для биокатализаторов в производстве биотоплива из-за ее ферментации глюкозы в широкий спектр короткоцепочечных спиртов и производства высокодеоксигенированных углеводородов. Бактерия Pectobacterium carotovorum подвид. carotovorum (P. carotovorum) печально известна своей мацерацией клеточной стенки растений, вызывающей мягкую гниль. Способность уничтожать растения обусловлена экспрессией и секрецией широкого спектра гидролитических ферментов, которые включают целлюлазы и полигалактуроназы. P. carotovorum ATCC™ № 15359 использовался в качестве источника ДНК для амплификации celB, celC и peh. Эти гены кодируют 2 целлюлазы и полигалактуроназу соответственно. Праймеры были разработаны на основе опубликованных последовательностей генов и использованы для амплификации открытых рамок считывания из геномной ДНК P. carotovorum. Отдельные продукты ПЦР были клонированы в вектор экспрессии pTAC-MAT-2 и трансформированы в Escherichia coli. Выведенные аминокислотные последовательности клонированных генов были проанализированы на предмет их каталитически активных доменов. Оценка молекулярной массы экспрессированных белков была выполнена с использованием анализа SDS-PAGE, и продукты celB, celC и peh были приблизительно 29,5 кДа, 40 кДа и 41,5 кДа соответственно. Качественное определение активности целлюлазы и полигалактуроназы клонированных генов было проведено с использованием анализов диффузии в агар.