Журнал исследований и разработок в области аквакультуры

Абстрактный

Молекулярная характеристика вителлогенина гигантского групера (Epinephelus Lanceolatus)

Ом А.Д. *, Шариф С., Джасмани С., Сунг Ю.Й., Болонг А.А.

Последовательность гена вителлогенина (Vtg) действует как индикатор воспроизводства рыб, который может адаптироваться к фактору окружающей среды или может влиять на развитие гонад. Нуклеотидная последовательность Vtg гигантского групера была охарактеризована с помощью программного обеспечения для биоинформатики. Поиск гомологии выведенной аминокислотной последовательности полученных ДНК Vtg (сравнение с 13 видами) был проведен с использованием веб-сайта Национального центра биотехнологической информации. Анализ Clustal W был построен с использованием молекулярно-эволюционного генетического анализа MEGA версии 5.2.2. Для проверки полученных последовательностей гена Vtg и выяснения структурно-функциональной связи в Vtg, с использованием DELTA BLAST трехмерной структуры гигантского групера с другими рыбами. Результат филогенетического анализа с использованием максимального правдоподобия (ML) и объединения соседей (NJ) показал, что анализ дерева сгенерировал две отдельные топологии дерева. Это сходство (0,015 расстояния матричного наблюдателя) было тесно связано с точки зрения их последовательности гена Vtg, хотя из разных экологических условий и условий окружающей среды. В целом, показано, что Epinephelus lanceolatus Vtg эволюционно более связан с Poecilia latipinna. Epinephelus lanceolatus показывает четыре основных домена (Vitellogenin-N, DUF1943, DUF1944 и VMD), аналогично обнаруженных у Dicentrachus labrax, но отличающихся по сравнению с Clarias macrochepalus, Catla catla и Danio rerio. Это указывает на то, что характеристикой домена Vtg для пресноводных видов является контроль присутствия VMD в Vtg. Молекулярный подход может быть применен к гигантскому груперу, чтобы понять молекулярный ответ на рост рыбы и определить особь гигантского групера, которая имеет потенциал для увеличения производства Vtg для повышения качества икры.