Журнал бактериологии и паразитологии

Абстрактный

Молекулярные подходы к обнаружению и характеристике лептоспир

Ахмед Ахмед, Мартин П. Гробуш, Пол Р. Клатцер и Руди А. Хартскирл

Традиционная диагностика лептоспироза и характеристика Leptospira spp. в основном опирается на серологию. Основным недостатком серологии в диагностике является то, что она требует достаточных уровней антител к Leptospira, что ставит под угрозу подтверждение на ранней острой фазе заболевания. Тест на перекрестную абсорбцию агглютинина (CAAT), который определяет серовары Leptospira, является технически сложным и трудоемким методом и поэтому проводится только в нескольких лабораториях. Новые молекулярные диагностические тесты в основном опираются на полимеразную цепную реакцию (ПЦР). ПЦР прекрасно дополняет серологическое тестирование, поскольку она особенно чувствительна в первые 5 дней после появления симптомов. ПЦР в реальном времени является быстрой и была подтверждена за ее высокую клиническую точность. Внедрение молекулярных методов для определения видов Leptospira произвело революцию в категоризации штаммов в этом роде, поскольку виды и серогруппы, по-видимому, показывают слабую корреляцию. Референтный тест в молекулярном видообразовании основан на определении гомологии ДНК. Этот подход утомителен и неудобен для пользователя, поэтому его все чаще заменяют другими методами. На сегодняшний день доступно множество методов молекулярного типирования. Наиболее привлекательными являются те методы, которые предоставляют прямые цифровые и переносимые в электронном виде данные. Такие методы включают флуоресцентный амплифицированный полиморфизм длины фрагмента (FAFLP), типирование массива, многолокусный анализ переменного числа тандемных повторов (MLVA) и основанную на последовательностях филогению, а также в некоторой степени импульсный гель-электрофорез (PFGE). Многолокусное типирование последовательностей (MLST) является наиболее надежным методом определения разнообразия штаммов Leptospira и в будущем, вероятно, будет превзойдено только филогенией на полных геномных последовательностях.