Клиническая и медицинская биохимия

Абстрактный

Молекулярная и морфологическая идентификация микробиоты кишечника рыб на разных стадиях роста Labeo rohita

Мухаммад Вакар Мажар, Ахмад Раза, Селинай Башак Эрдемли Кёсе, Хира Ифтихар, Хира Тахир, Хе-Мин Чжоу, Мудасара Сикандар, Цветина Николова, Эйша Джавед

Введение: Микробиота кишечника играет важную роль в здоровье и патогенности рыб. L.rohita — хорошо известная рыбка, выращиваемая на фермах, ее также разводят вместе с другими крупными карпами.

Методология: Настоящее исследование было проведено с целью определения молекулярной и морфологической идентификации кишечной микробиоты L.rohita , собранной в рыбоводном хозяйстве Фейсалабада. Выделение бактерий проводилось с помощью методов культивирования. Морфологическая идентификация бактериальных изолятов проводилась с помощью окрашивания по Граму, биохимических тестов TSI и теста MR-VP. Молекулярная идентификация проводилась с помощью методов 16S рРНК.

Результаты: Результаты настоящей исследовательской работы показали, что 20 штаммов бактерий были выделены из кишечника L.rohita , и все эти изоляты были грамотрицательными и морфологически идентифицированы на основе биохимических тестов, т.е. TSI и MR-VP. Результат биопленки показал, что шесть, восемь и шесть изолятов показали слабую, среднюю и сильную биопленку.

Заключение: Самая высокая и самая низкая устойчивость была выявлена ​​к цефадроксилу и левофлоксину соответственно. Самые низкие промежуточные изоляты были обнаружены к цефадроксилу, полимиксину В и колистину, а самые высокие промежуточные — к цефтриаксону. Самые высокие чувствительные изоляты были обнаружены к левофлоксину, а самые низкие — к цефадроксилу, нитрофурантоину и цефокситину. На основе секвенирования РНК 16Sr и филогенетической связи между изолятами в настоящем исследовании было определено 17 изолятов. В кишечнике L.rohita были обнаружены Klebsiella pneumonia, Enterobacter cloacae, Pseudomonas oleovorans, Morganella morganii, Citrobacter freundii, Proteus mirabilis, Citrobacter braakii, Enterobacter hormaechei, Psychrobacter sanguinis, Shigella dysenteriae, Citrobacter cronae, Shigella sonnei, Pseudomonas sihuiensis, Proteus mirabilis, Enterobacter hormaechei .