Биохимия и аналитическая биохимия

Абстрактный

Анализ митохондриального генома и филогения, а также оценка времени дивергенции Strix aluco

Дэвид Смит1, Ренна Рой2*

В этом исследовании впервые был представлен полный митохондриальный геном Strix aluco общей длиной 18 632 п.н. Было 37 генов, включая 22 тРНК, 2 рРНК, 13 генов кодирования белков (PCG) и 2 некодирующих контрольных региона (D-петля). Секвенирование второго поколения полного митохондриального генома S. aluco было проведено с использованием платформы Illumina, а затем Tytoninae использовалась в качестве внешней группы, программное обеспечение PhyloSuite было применено для построения ML-дерева и BI-дерева Strigiformes , и, наконец, дерево времени расхождения было построено с использованием программного обеспечения Beast 2.6.7, возраст осадков, содержащих ископаемые остатки Miosurniadiurna (6,0~9,5 мА), был установлен в качестве внутренней точки коррекции. Было подтверждено, что общий предок Strix разделился в плейстоцене (2,58~0,01 мА). Резкое поднятие гор Циньлин в среднем плейстоцене и климатические колебания плейстоцена вместе вызвали расхождение Strix между северной и южной частями материкового Китая. Изоляция ледниково-межледникового вращения и ледникового убежища была основной причиной расхождения общего предка Strix uralensis и S. aluco в этот период. Это исследование дает ссылку на историю эволюции Strix .