Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Выделение и секвенирование генов актина 1, актина 2 и тубулина 1, участвующих в формировании цитоскелета у Phytophthora cinnamomi

Ивон Мартинс, Кармен Лопес, Анхель Домингес и Альтино Шупина

Оомицеты из рода Phytophthora — это грибовидные патогены растений, которые губительны для сельского хозяйства и природных экосистем. В регионе Nordeste Transmontano (северо-восток Португалии) чрезвычайно важна культура каштана Castanea sativa. Наибольший спад производительности и урожайности происходит из-за чернильной болезни, вызываемой Phytophthora cinnamomi , которая является одним из наиболее широко распространенных видов Phytophthora , с почти 1000 видами-хозяевами. Знание молекулярных механизмов, ответственных за патогенность, является важным инструментом для борьбы с сопутствующими заболеваниями этого патогена. Полные открытые рамки считывания (ORF) генов act1, act2 и tub1, которые участвуют в формировании цитоскелета у P. cinnamomi, были получены с помощью высокоэффективной термоасимметричной переплетенной (HE-TAIL) полимеразной цепной реакции (ПЦР). Ген act1 содержит ORF размером 1128 п.н., кодирующий выведенный белок из 375 аминокислот (а.о.) и 41 972 кДа. ORF act2 содержит 1083 п.н. и кодирует выведенный белок из 360 а.о. и 40 237 кДа. tub1 имеет общую длину 2263 п.н. и кодирует белок из 453 а.о. с молекулярной массой 49,911 кДа. Биоинформатический анализ показывает, что actin1 является ортологом генов act1 Phytophthora infestans, Phytophthora megasperma и Phytophthora melonis; actin2 является ортологом генов act2 P. infestans, Phytophthora brassicae, P. melonis и Pythium splendens , а tubulin1 демонстрирует самую высокую ортологию генам α-тубулина P. infestans и P. capsici .
Анализ трехмерной структуры трех предполагаемых белков выявил пространственную конформацию, очень похожую на описанную для ортологичных белков, полученных с помощью рентгеновской дифракции.