Биохимия и аналитическая биохимия

Абстрактный

Взаимодействие между ионной жидкостью на основе пирролидиния и бычьим сывороточным альбумином: спектроскопическое и молекулярное понимание стыковки

Раджан Патель, Мина Кумари, Нирадж Дохаре, Аббул Башар Хан, Прашант Сингх, Максуд Ахмад Малик и Амит Кумар

В данной работе мы сообщаем о взаимодействии йодида N, N-диметил-2-оксопирролидиния с бычьим сывороточным альбумином с использованием стационарной флуоресценции, флуоресценции с временным разрешением, УФ-видимой и Фурье-инфракрасной спектроскопии в сочетании с методом молекулярного докинга. Результаты спектров стационарной флуоресценции подтвердили, что йодид N, N-диметил-2-оксопирролидиния сильно гасит собственную флуоресценцию бычьего сывороточного альбумина с помощью динамического механизма гашения, что подтверждено спектроскопией флуоресценции с временным разрешением. Термодинамические параметры (ΔH, ΔG и ΔS) показали, что процесс связывания был спонтанным и энтальпийно-обусловленным. Более того, силы взаимодействия между бычьим сывороточным альбумином и N, N-диметил-2-оксопирролидинием в основном регулировались водородной связью и силами Ван-дер-Ваальса. Результаты Фурье-преобразования-инфракрасной спектроскопии показывают конформационные изменения бычьего сывороточного альбумина при связывании с N, N-диметил-2-оксопирролидинием. Кроме того, результаты молекулярного моделирования показали, что N, N-диметил-2-оксопирролидиний связывается с аминокислотными остатками субдомена IIA бычьего сывороточного альбумина.