Журнал интеллектуального анализа данных в геномике и протеомике

Абстрактный

Взаимодействие белков и путей в мозговой ткани человека при болезни Альцгеймера с использованием масс-спектрометрии

Малати Нараян, Лиза Кируак, Дейл Чапут, Стэнли Стивенс, Джая Падманабхан и Умеш К. Джинвал

Болезнь Альцгеймера (БА) является наиболее распространенной формой деменции и 6-й ведущей причиной смерти в Соединенных Штатах. Основные патологические признаки, наблюдаемые при БА, включают образование внутриклеточных нейрофибриллярных клубков, состоящих из фосфорилированных форм белка тау, связанного с микротрубочками, и отложение внеклеточных бляшек, состоящих из бета-амилоида. Cdc37 является ко-шапероном Hsp90, который привлекает клиентские киназы к комплексу Hsp90 для сворачивания и стабилизации. Ранее было показано, что Cdc37 может не только связывать и сохранять тау, но и стабилизировать киназы, которые могут фосфорилировать тау. Целью текущего исследования было выявление новых взаимодействующих с Cdc37 белков в ткани человека с БА по сравнению с нормальной тканью с использованием подхода, основанного на иммунопреципитации, в сочетании с масс-спектрометрией. Мы идентифицировали 39 уникальных белков, которые взаимодействовали с Cdc37 только в образцах с болезнью Альцгеймера, и 7 белков, которые взаимодействовали с Cdc37 только в нормальных образцах. Было обнаружено, что 39 белков связывают Cdc37 как в ткани с болезнью Альцгеймера, так и в нормальной ткани. Из них 18 показали повышенное взаимодействие в ткани с болезнью Альцгеймера, 10 показали повышенное взаимодействие в нормальной ткани и 11 показали одинаковое взаимодействие в обоих образцах. Анализ данных Ingenuity Pathway показывает, что эти взаимодействующие с Cdc37 белки могут передавать сигналы через пути p70S6K, PI3K / Akt, TGFß, ErbB, NF-kB, кальмодулин, p38 MAPK и JNK. Идентификация этих новых белков и путей, связанных с Cdc37, может указывать на его роль как некиназного кошаперона, так и в других путях в мозге с болезнью Альцгеймера.