Биология и медицина

Абстрактный

Интегративные биоинформатические подходы к анализу молекулярных событий в плюрипотентности

Приянка Нарад и Упадхьяя К.С.

Человеческие эмбриональные стволовые клетки (hESC) обладают способностью размножаться практически бесконечно. Анализ профилей экспрессии генов hESC может дать представление о важнейших генах, участвующих в поддержании плюрипотентности, и генах, которые могут быть вовлечены в клеточную дифференциацию. Объединение сетевых и высокопроизводительных данных позволяет понять роль эпигенетических механизмов, сигнальных путей и факторов транскрипции, ответственных за плюрипотентность человека, и скрининг предполагаемых механистических связей, проверку существующих знаний, выдвижение гипотез и предложений для новых экспериментов. Расшифровка концентратора факторов и их связанных взаимодействий является важным началом для понимания сложностей, связанных с hESC, и передачи знаний для создания человеческих индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (hIPS). Этот обзор направлен на увеличение элементарной информации интегративных биоинформатических подходов, полезных для изучения процессов самообновления и дифференциации с использованием новых целостных данных об экспрессии генов и эпигенетических метках, связанных с клеточной плюрипотентностью. Два основных подхода, а именно представление в виде биологических сетей и семантическая веб-технология, были описаны для управления постоянно растущими данными высокой пропускной способности. Интегрированный подход к распутыванию биологических сложностей был бы весьма полезен в области медицинских и оздоровительных наук