Биология и медицина

Абстрактный

Моделирование Insilco часто встречающегося генетического полиморфизма человеческого CYP3A4 по связывающей способности с UR-144

Амене Тесфайе и Либаргачев Демли

CYP3A4 составляет около 30% в метаболизме ксенобиотиков в печени человека. Было обнаружено, что защитный механизм ферментов, метаболизирующих лекарства или ксенобиотики, в частности суперсемейство CYP, изменяется как под действием генетических полиморфизмов, так и под действием факторов окружающей среды. Целью данного исследования было изучение связывания UR-144 с CYP3A4 дикого типа и шестью различными природными вариантами (I118V, R130Q, R162Q, D174H, T185S и L373F). Жесткий лиганд был пристыкован AutoDock Vina к гибким аминокислотным остаткам, выбранным из остатков, формирующих связывающий карман. Анализ результатов стыковки показал, что нет никакой разницы в сродстве связывания между диким типом и естественными вариантами. Однако, сравнивая абсолютное сродство связывания, дикий тип (-12,8 ккал/моль) показал, среди всех, самую низкую энергию связывания. Таким образом, данное исследование показывает, что однонуклеотидные полиморфизмы CYP3A4 не оказывают никакого влияния на связывающую способность UR-144 с активным сайтом.