Биохимия и аналитическая биохимия

Абстрактный

Выявление предполагаемых лекарственных мишеней и кандидатов на вакцины против патогенов, вызывающих атеросклероз

Канипакам Хема, Вани Приядаршини I, Дибьябхаба Прадхан, Манне Муникумар, Сваргам Сандип, Сваргам Сандип, Натараджан Прадип, Сучитра М.М. и Аминени Умамахешвари

Атеросклероз — хроническое воспалительное заболевание артерий, вызывающее как сердечно-сосудистые (сердечные), так и цереброваскулярные (мозговые) инсульты с высокой заболеваемостью и смертностью во всем мире. В недавних эпидемиологических исследованиях показано, что инфекционные патогены, такие как Chlamydophila pneumoniae, Porphyromonas gingivalis и Helicobacter pylori, связаны с этим заболеванием. Поэтому идентификация общих мишеней для лекарственных препаратов и кандидатов на вакцины против этих трех патогенов будет иметь жизненно важное значение для терапии и управления атеросклерозом. Chlamydophila pneumonia была выбрана в качестве контрольного организма из-за ее преобладающей роли в атеросклерозе. Внедряя сравнительный геномный подход, субтрактивный геномный подход, анализ метаболических путей, анализ негомологичной кишечной флоры и анализ поиска доменов, было идентифицировано 35 общих предполагаемых мишеней для лекарственных препаратов против патогенов атеросклероза. Были проведены исследования субклеточной локализации и идентифицирован белок UvrABC как кандидат на вакцину. Анализ метаболических путей показал, что из 35 лекарственных мишеней 14 ферментов участвовали в ключевых путях, связанных с выживанием, пролиферацией и патогенезом патогена без какого-либо альтернативного механизма синтеза продукта. Анализ микробиоты кишечника был проведен для выявления лекарственных мишеней, которые не влияют на микробиоту человека. Поиск доменов был выполнен для выявленных 14 лекарственных мишеней с использованием баз данных Pfam и SMART, а анализ белковых сетей был проведен с использованием STRING и Cytoscape v3.2.0. Лекарственные мишени и кандидаты на вакцины, предложенные в настоящем исследовании, послужат основой для разработки мощных ингибиторов и субъединичных вакцин с помощью подхода in silico для борьбы с атеросклерозом, вызванным инфекционными патогенами.