Журнал микробных и биохимических технологий

Абстрактный

Идентификация новых ингибиторов протеазы NS3-4A вируса гепатита С с помощью подхода виртуального скрининга

Аниш Кумар, Рашми Гупта, Каника Верма, Кшития Айер, Шанти В. и К. Раманатан

Вирус гепатита С (HCV) является основной причиной цирроза и рака печени во всем мире. Репликация и созревание вирусного полипротеина HCV в решающей степени зависят от расщепления предшественника полипротеина на 10 вирусных белков. Сериновая протеаза NS3-4A расщепляет неструктурную область полипротеина в четырех из пяти соединений, поэтому является перспективной целью для разработки противовирусных ингибиторов. В клинических испытаниях участвует множество ингибиторов протеазы NS3/4A HCV, и улучшения указывают на значительное снижение частоты вирусных инфекций. Однако большинство ИП развивают варианты, связанные с резистентностью, во время лечения и ограничиваются одним или двумя генотипами HCV. Единственным исключением является ИП второго поколения, MK-5172, который эффективно ингибирует большинство вариантов, связанных с резистентностью к ИП первого поколения, и является пангенотипическим. В этом исследовании мы исследовали сильнодействующие соединения-лидеры на основе поиска по сходству с использованием самого сильнодействующего доказанного ингибитора протеазы MK-5172. Мы выполнили виртуальные методы скрининга с использованием базы данных PubChem, доступной в NCBI, для идентификации молекул, подобных свинцу. База данных выдала 32 совпадения для поиска по сходству 95%, и для проверенных соединений был выполнен фармакокинетический анализ (ADME). Этот дизайн препарата на основе структуры выявил три лидирующих соединения, которые могут лучше работать против протеазы NS3/4A.