Журнал бактериологии и паразитологии

Абстрактный

Идентификация клинических штаммов Corynebacterium striatum методом ПЦР-рестрикционного анализа с использованием гена β-субъединицы РНК-полимеразы (rpob)

Сана Алиби, Асма Ферджани, Манель Марзук и Джалель Букадида

Corynebacterium striatum часто встречается в обычной клинической микробиологической лаборатории. Он широко распространен в окружающей среде и является частью нормальной микробиоты кожи и слизистых оболочек. Идентификация этого вида биохимическими методами остается сложной, и ранее сообщалось о нескольких ошибочных идентификациях. Метод полимеразной цепной реакции с полиморфизмом длины фрагмента рестрикции (ПЦР-ПДРФ) для идентификации этого микроорганизма был разработан на основе гипервариабельной области полиморфного гена β-субъединицы РНК-полимеразы (rpoB). Все доступные последовательности rpoB Corynebacterium были проанализированы с помощью компьютерного рестрикционного анализа. Паттерн rpoB ПЦР-ПДРФ, предсказанный с использованием эндонуклеаз MseI и NlaIV, четко дифференцировал C. striatum от всех других видов Corynebacterium. Этот метод был успешно применен для надежной идентификации 67 клинических изолятов C. striatum и может быть использован для своевременного выявления инфицированных пациентов или для эпидемиологических исследований.