Журнал микробных и биохимических технологий

Абстрактный

Идентификация и характеристика генов gtf, norB и trx в Flavobacterium Columnare

Иньфэн Чжан и Ковадонга Р. Ариас

Три гена из геномной библиотеки дробовика вирулентного штамма Flavobacterium columnare ALG-00-530 были идентифицированы, охарактеризованы и отобраны для дифференциального анализа экспрессии на основе сходства последовательностей с предполагаемыми генами вирулентности родственных видов. Этими генами были: гликозилтрансфераза (gtf), редуктаза оксида азота (norB) и тиоредоксин (trx). Коллекция из 30 штаммов F. columnare, включая штаммы из геномоваров I и II, была протестирована на наличие этих генов. Паттерны распределения gtf, norB и trx по видам были неравномерными. Наблюдалось изменение нуклеотидной последовательности между геномоваром для каждого гена; однако штаммы в пределах одного геномовара имели идентичные последовательности генов. Для анализа экспрессии генов были выбраны девять штаммов F. columnare из обоих геномоваров. Профиль экспрессии этих генов различался, когда выбранные штаммы выращивались in vitro в идентичных условиях. ALG-00-530, высоковирулентный штамм, был выбран для сравнения экспрессии генов в стандартных условиях выращивания, условиях с ограниченным содержанием железа и в присутствии эксплантатов кожи канального сома. Уровни экспрессии генов NorB и trx варьировались, когда ALG-00-530 инкубировали в различных условиях.