Журнал фармакогеномики и фармакопротеомики

Абстрактный

Самодельная ДНК-лестница из 100 пар оснований на основе бактериальной плазмиды pMAL-C2X

Фирузе Бадре1, Ходакарам Джаханбин2, Али Ходадади2, Али Хорасани Заде2, Муса Шарифат2, Милад Хаяти2, Мохаммад Рашно2,3

Предыстория: Для большинства результатов исследований в области молекулярной биологии требуются маркеры, такие как ДНК-лестницы, для обнаружения и количественной оценки длины фрагментов нуклеиновых кислот с помощью электрофореза в рутинной задаче.

Методы: В этом исследовании мы сообщаем о методе подготовки лестницы ДНК из 100 пар оснований на основе техники ПЦР. Бактериальная плазмида pMAL-C2X использовалась в качестве шаблона ДНК в ПЦР. Продукты ПЦР были извлечены фенолом/хлороформом, осаждены этанолом и смешаны пропорционально.

Результаты: Наконец, набор из 7 праймеров (5 обратных и 2 прямых) был успешно разработан. Амплифицированные фрагменты ПЦР были количественно оценены с помощью nanodrop, а размер полос был оценен с помощью гель-электрофореза вместе с сопутствующей мигрирующей коммерческой лестницей 100 п.н. в 1,5% агарозном геле. Результаты показали, что четкие и резкие полосы 100 п.н.-1000 п.н. были успешно получены одной реакцией в ПЦР.

Вывод: Наш домашний продукт является конкурентоспособным продуктом на коммерческом рынке и может быть приготовлен простым и недорогим методом с низкой вероятностью неспецифической полосы.