Журнал исследований и терапии стволовых клеток

Абстрактный

Массовое секвенирование всего генома в биологии эмбриональных стволовых клеток: последние идеи и проблемы

Яофэн Ван, Алекс Чун Чунг, Цзюнь-Тао Го и Бо Фэн

Открытие плюрипотентных эмбриональных стволовых клеток (ЭСК) у млекопитающих значительно изменило исследования стволовых клеток и регенеративную медицину. Для понимания молекулярного механизма плюрипотентности были приняты технологии массового секвенирования с интенсивным научным интересом из-за их преимуществ, включая высокое разрешение, низкий уровень шума, а также их обширный охват по всему геному. Здесь мы рассмотрим принципы технологий массового секвенирования генома, широко применяемых в исследованиях ЭСК, включая ChIP-Seq, RNA-Seq и methylCSeq. Также будут обсуждаться недавние усовершенствования и применения этих технологий. Кроме того, будет представлено резюме различных методологий, используемых для интеграции данных массового секвенирования генома. Интеграция массивных данных, которые описывают различные аспекты ЭСК, может подтолкнуть к многочисленным инновациям для понимания сетей транскрипции в поддержании плюрипотентности, а также регуляции генов и эпигенетических модификаций в ЭСК, которые важны для исследований и клинических приложений. Кроме того, мы выделяем особенности, на которые биологам следует обратить внимание в связи с текущими проблемами анализа массивных данных секвенирования в биоинформатике и биостатистике.