Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Генетическая изменчивость среди пенициллов, выделенных из цитрусовых в условиях хранения

Ахмад Али Шахид, Мехра Азам, Мухаммед Али, Киран Наваз и Моаззам Анис

Пакистан является шестым по величине производителем Kinow (мандаринов) и апельсинов в мире с объемом производства 2,1 млн тонн. В ходе этого исследования были посещены рынки фруктов и овощей в Лахоре, и было собрано сорок образцов инфицированных цитрусовых, поверхность которых была стерилизована и инокулирована на картофельно-декстрозной агаровой среде для изоляции. Согласно микроскопии и характеристикам колоний были идентифицированы пять видов рода Penicillium (P. digitatum, P. expansum, P. biourgeianum). Геномная ДНК была выделена, а внутренний транскрибируемый спейсер (ITS) был амплифицирован с использованием праймеров ITS 1 и ITS4 и генов 5.8S рРНК грибов. Очищенные и амплифицированные продукты ПЦР были позднее секвенированы, а секвенированная гомология была изучена с помощью BLAST и поиска по базам данных программного обеспечения Genebank или NCBI. Гомология последовательности ДНК показала, что изоляты содержат более 98% гомологии с известными последовательностями ДНК P. expansum, P. digitatum и P. biourgeianum в банке данных генов. Среди этих грибковых изолятов P. biourgieanum был еще одним недавно зарегистрированным видом, выделенным из инфицированных цитрусовых, и ему был присвоен номер доступа банка генов NCBI KT336317.