Журнал интеллектуального анализа данных в геномике и протеомике

Абстрактный

Уровень экспрессии генов и анализ обогащения набора генов хозяина

Ёсукэ Кондо, Сатору Миядзаки

Анализ всего генома показал, что существуют некодирующие белки РНК (нкРНК), которые локализуются в интронных областях генов, кодирующих белки. Интронные нкРНК размещаются в интронах генов, кодирующих белки, которые называются генами хозяина. В нашем предыдущем исследовании сообщалось о геномных особенностях генов интронных нкРНК и генов хозяина. Однако транскриптомные особенности генов хозяина не были исследованы. Здесь мы сообщаем об анализе уровня экспрессии генов хозяина и исследуем биологические функции генов хозяина. Наши результаты показали, что уровни экспрессии генов хозяина, как правило, выше, чем у генов не хозяина. Гены хозяина, ортологичные между человеком и мышью, имеют более консервативные уровни экспрессии, чем ортологичные гены не хозяина. А гены хозяина с высокими уровнями экспрессии затрагивают нервную систему, экспрессию генов, модификацию белков и цитоскелет, тогда как в генах хозяина с низкими уровнями экспрессии в основном не было обогащенных биологических функций. Эти результаты предполагают, что гены хозяина имеют характерную количественную оценку транскрипта и биологические функции. Характеристики могут быть полезны для дальнейшего анализа регуляторных путей экспрессии генов хозяина.