Агротехника

Абстрактный

Оценка генетического разнообразия воздушного ямса ( Dioscorea bulbifera L) с использованием маркеров простых повторов последовательностей (SSR)

Аниефиок Ндубуиси Осуагву, Эдем УЛ

Dioscorea bulbifera — малоиспользуемая культура семейства Dioscoreacea, широко распространенная в тропических и южных регионах Западной Африки. Двадцать пять образцов D. bulbifera из Западной Африки, хранящихся в банке зародышевой плазмы Международного института тропического сельского хозяйства (IITA), были проверены на генетическое разнообразие с использованием десяти микросателлитных локусов в реакции объемом 25 мкл в реакциях ПЦР на 96-луночном микротитровальном планшете. Реакционная смесь состояла из 3 мкл 10 нг/ мкл ДНК-матрицы, 2 мкл 2,5 мМ DNTP, 1 мкл 2,5 мМ MgCl2 , по 1 _мкл прямого и обратного праймеров, 1 мкл DMSO4 , 0,1 мкл ₅ мкг / мкл Taq ДНК-полимеразы (Invitrogen) и 3 мкл 10 нг/ мкл ДНК. Общий объем реакции был доведен до 25 объемов с использованием 13,4 мкл воды, свободной от нуклеазы . Программа ПЦР состояла из денатурации при 94°C в течение 30 секунд, за которой следовали 35 циклов при 94°C в течение 30 секунд, 55 или 45°C в течение 20 секунд и 72°C в течение 30 секунд, с заключительным этапом удлинения при 72°C в течение 7 минут. Всего было обнаружено 74 аллеля со средним числом аллелей 7,4 на локус. Среднее значение полиморфного информационного содержания (PIC) 0,74 показало наличие изменчивости среди образцов. Также наблюдалось среднее значение генного разнообразия 0,77. Подход SSR оказался ценным инструментом для определения генетического разнообразия и взаимосвязей между образцами D. bulbifera . Эти результаты имеют важное значение в программе сохранения и генетического улучшения этой культуры.